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家禽流行性感冒由於病毒構造特殊，以致有很多的血清亞型，雖然所有亞型幾乎都可感染各種禽鳥類，但從有病例報告的1878年至2003年，只有19次有重大經濟損失的報告，而且都是由H5和H7二種血清亞型所引起，大量傷亡的禽類也以陸禽類為主。
在1980年以前這種引起大量死亡的家禽流行性感冒被稱為”雞瘟”，而在1980年之後就被稱為高病原性家禽流行性感冒(HPAI)，而相對的，感染家禽流行性感冒病毒，而不會有明顯致病死亡的就被稱為低病原性家禽流行性感冒(LPAI)。
由於家禽流行性感冒病毒株很複雜，因此它的命名也比較特別，其命名方法依序標明：血清型別/分離動物別/分離地名/病例編號/分離年代(HxNy)，例如1999年在義大利火雞爆發的高病原性家禽流行性感冒病毒分離株命名為A/Turkey/Italy/4580/99(H7N1)。
至今被公認的是水禽類包括水禽類候鳥可以感染所有H亞型的家禽流行性感冒病毒，但通常不會有臨床症狀，因此它們成為主要的家禽流行性感冒病毒保毒者及傳播源。
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